Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC1Q5TB30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPDC1Q5TB30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEPDC1Q5TB30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DEPDC1Q5TB30 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEPDC1Q5TB30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms