Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP58Q5T655 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP58Q5T655 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP58Q5T655 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP58Q5T655 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP58Q5T655 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms