Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms