Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZK1Q5T2W1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZK1Q5T2W1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZK1Q5T2W1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDZK1Q5T2W1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1Q5T2W1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1Q5T2W1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms