Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CFAP70Q5T0N1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CFAP70Q5T0N1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CFAP70Q5T0N1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFAP70Q5T0N1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CFAP70Q5T0N1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CFAP70Q5T0N1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFAP70Q5T0N1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CFAP70Q5T0N1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CFAP70Q5T0N1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CFAP70Q5T0N1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFAP70Q5T0N1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFAP70Q5T0N1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFAP70Q5T0N1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFAP70Q5T0N1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFAP70Q5T0N1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms