Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CC2D1BQ5T0F9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CC2D1BQ5T0F9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CC2D1BQ5T0F9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CC2D1BQ5T0F9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CC2D1BQ5T0F9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CC2D1BQ5T0F9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
CC2D1BQ5T0F9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CC2D1BQ5T0F9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CC2D1BQ5T0F9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D1BQ5T0F9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D1BQ5T0F9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D1BQ5T0F9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms