Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPDYCQ5MJ68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPDYCQ5MJ68 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPDYCQ5MJ68 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYCQ5MJ68 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms