Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN3Q5JUX0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPIN3Q5JUX0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN3Q5JUX0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN3Q5JUX0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms