Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIA3Q5JRA6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIA3Q5JRA6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MIA3Q5JRA6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIA3Q5JRA6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIA3Q5JRA6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms