Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRRT3Q5FWE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRRT3Q5FWE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRRT3Q5FWE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRT3Q5FWE3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRT3Q5FWE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRT3Q5FWE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms