Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALFQ53S48 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALFQ53S48 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALFQ53S48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALFQ53S48 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALFQ53S48 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms