Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFTN2Q52LD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFTN2Q52LD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFTN2Q52LD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFTN2Q52LD8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms