Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf46Q504U0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf46Q504U0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf46Q504U0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms