Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf22Q49AR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf22Q49AR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf22Q49AR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf22Q49AR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C5orf22Q49AR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C5orf22Q49AR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C5orf22Q49AR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms