Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP27-1Q3LI81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRTAP27-1Q3LI81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTAP27-1Q3LI81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP27-1Q3LI81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP27-1Q3LI81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms