Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3H1Q32P28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
P3H1Q32P28 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
P3H1Q32P28 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
P3H1Q32P28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
P3H1Q32P28 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
P3H1Q32P28 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms