Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED3Q2MJR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRED3Q2MJR0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRED3Q2MJR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPRED3Q2MJR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRED3Q2MJR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRED3Q2MJR0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms