Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF4Q2M2E3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ODF4Q2M2E3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF4Q2M2E3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF4Q2M2E3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms