Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC36Q1X8D7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC36Q1X8D7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC36Q1X8D7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC36Q1X8D7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC36Q1X8D7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms