Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN21Q16825 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN21Q16825 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPN21Q16825 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN21Q16825 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN21Q16825 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN21Q16825 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
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