Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIF1AQ16665 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIF1AQ16665 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIF1AQ16665 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIF1AQ16665 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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