Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDK4Q16654 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDK4Q16654 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDK4Q16654 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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