Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNXAQ16473 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNXAQ16473 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNXAQ16473 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNXAQ16473 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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