Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3A2Q15428 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3A2Q15428 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3A2Q15428 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3A2Q15428 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms