Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD1Q15116 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD1Q15116 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCD1Q15116 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD1Q15116 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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