Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL19A1Q14993 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL19A1Q14993 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL19A1Q14993 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL19A1Q14993 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COL19A1Q14993 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL19A1Q14993 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL19A1Q14993 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL19A1Q14993 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL19A1Q14993 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL19A1Q14993 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL19A1Q14993 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL19A1Q14993 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL19A1Q14993 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
COL19A1Q14993 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COL19A1Q14993 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL19A1Q14993 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL19A1Q14993 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL19A1Q14993 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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