Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC3Q14574 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC3Q14574 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DSC3Q14574 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSC3Q14574 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSC3Q14574 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSC3Q14574 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC3Q14574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC3Q14574 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC3Q14574 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC3Q14574 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSC3Q14574 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSC3Q14574 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSC3Q14574 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms