Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPIDRQ14159 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPIDRQ14159 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPIDRQ14159 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIDRQ14159 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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