Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKAP5Q14008 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP5Q14008 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKAP5Q14008 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP5Q14008 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CKAP5Q14008 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKAP5Q14008 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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