Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOFQ13790 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOFQ13790 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOFQ13790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOFQ13790 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOFQ13790 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOFQ13790 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOFQ13790 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOFQ13790 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOFQ13790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOFQ13790 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOFQ13790 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOFQ13790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOFQ13790 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOFQ13790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOFQ13790 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOFQ13790 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOFQ13790 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOFQ13790 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOFQ13790 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOFQ13790 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOFQ13790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOFQ13790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOFQ13790 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOFQ13790 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOFQ13790 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOFQ13790 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOFQ13790 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOFQ13790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOFQ13790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOFQ13790 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOFQ13790 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOFQ13790 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOFQ13790 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOFQ13790 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOFQ13790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOFQ13790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOFQ13790 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOFQ13790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOFQ13790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOFQ13790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOFQ13790 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOFQ13790 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOFQ13790 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOFQ13790 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOFQ13790 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOFQ13790 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOFQ13790 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOFQ13790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOFQ13790 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOFQ13790 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOFQ13790 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOFQ13790 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOFQ13790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOFQ13790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOFQ13790 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOFQ13790 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOFQ13790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOFQ13790 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOFQ13790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOFQ13790 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOFQ13790 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOFQ13790 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOFQ13790 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOFQ13790 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOFQ13790 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOFQ13790 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOFQ13790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOFQ13790 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOFQ13790 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOFQ13790 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOFQ13790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOFQ13790 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOFQ13790 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOFQ13790 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOFQ13790 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOFQ13790 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOFQ13790 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOFQ13790 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOFQ13790 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOFQ13790 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOFQ13790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOFQ13790 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOFQ13790 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOFQ13790 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOFQ13790 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOFQ13790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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