Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTCH1Q13635 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTCH1Q13635 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTCH1Q13635 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PTCH1Q13635 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTCH1Q13635 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PTCH1Q13635 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTCH1Q13635 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTCH1Q13635 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTCH1Q13635 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
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