Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PWP1Q13610 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PWP1Q13610 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PWP1Q13610 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PWP1Q13610 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PWP1Q13610 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms