Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRR1Q13601 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRR1Q13601 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRR1Q13601 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRR1Q13601 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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