Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD4Q13485 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD4Q13485 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD4Q13485 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMAD4Q13485 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD4Q13485 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms