Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTA1Q13424 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTA1Q13424 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNTA1Q13424 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNTA1Q13424 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNTA1Q13424 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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