Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNASEH2B-204ENST00000465541 498 ntTSL 55.4□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C11orf1-201ENST00000260276 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 64.1
PABPC4Q13310 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 64.1
PABPC4Q13310 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 64.1
PABPC4Q13310 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.236e-9■■■■■ 63.9
PABPC4Q13310 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.236e-9■■■■■ 63.9
PABPC4Q13310 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-9■■■■■ 63.8
PABPC4Q13310 MRS2-201ENST00000274747 3821 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 63.8
PABPC4Q13310 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.541e-9■■■■■ 63.8
PABPC4Q13310 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.253e-10■■■■■ 63.8
PABPC4Q13310 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 63.6
PABPC4Q13310 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 63.6
PABPC4Q13310 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 63.6
PABPC4Q13310 OPTN-206ENST00000378764 2498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-201ENST00000263036 2464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 OPTN-209ENST00000469025 642 ntTSL 36.89□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 63.3
PABPC4Q13310 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 63.1
PABPC4Q13310 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 63.1
PABPC4Q13310 PHKA2-203ENST00000469485 1945 ntTSL 218.92■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 63.1
PABPC4Q13310 PHKA2-207ENST00000481718 3115 ntTSL 211.2□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 63.1
PABPC4Q13310 PARK7-207ENST00000469225 711 ntTSL 311.24□□□□□ -0.615e-13■■■■■ 62.5
PABPC4Q13310 CUX1-209ENST00000487284 1566 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-20■■■■■ 62.1
PABPC4Q13310 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-17■■■■■ 62
PABPC4Q13310 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 61.9
PABPC4Q13310 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.849e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.659e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.469e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.919e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.939e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.999e-10■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.441e-23■■■■■ 61.6
PABPC4Q13310 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.739e-8■■■■■ 61.5
PABPC4Q13310 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.669e-8■■■■■ 61.5
PABPC4Q13310 NLN-207ENST00000509935 1106 ntTSL 59.02□□□□□ -0.979e-8■■■■■ 61.5
PABPC4Q13310 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.359e-8■■■■■ 61.5
PABPC4Q13310 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-9■■■■■ 61.5
PABPC4Q13310 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 GALM-204ENST00000434934 724 ntTSL 34.63□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-204ENST00000412779 896 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-201ENST00000340900 878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-203ENST00000397970 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.565e-19■■■■■ 61.4
PABPC4Q13310 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 61.3
PABPC4Q13310 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.63e-11■■■■■ 61.3
PABPC4Q13310 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.222e-12■■■■■ 61.3
PABPC4Q13310 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-20■■■■■ 61.1
PABPC4Q13310 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 61
PABPC4Q13310 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.494e-16■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.84e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-218ENST00000511736 956 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.274e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 512.91□□□□□ -0.344e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-203ENST00000502623 760 ntTSL 36.92□□□□□ -1.34e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.344e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.364e-14■■■■■ 60.7
PABPC4Q13310 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.235e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.945e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.195e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.735e-10■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 NPM1-212ENST00000524204 640 ntTSL 26.26□□□□□ -1.411e-323■■■■■ 60.6
PABPC4Q13310 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MXI1-210ENST00000485566 2755 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 60.5
PABPC4Q13310 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt18.96■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.11e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 56.89□□□□□ -1.311e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.491e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.51e-20■■■■■ 60.4
PABPC4Q13310 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-30■■■■■ 60
PABPC4Q13310 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.952e-30■■■■■ 60
PABPC4Q13310 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-30■■■■■ 60
PABPC4Q13310 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.767e-12■■■■■ 59.9
PABPC4Q13310 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-12■■■■■ 59.9
PABPC4Q13310 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.758e-10■■■■■ 59.8
PABPC4Q13310 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.129e-18■■■■■ 59.7
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 350.6 ms