Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF3Q13114 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF3Q13114 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF3Q13114 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF3Q13114 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF3Q13114 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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