Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1IP1Q13113 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1IP1Q13113 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1IP1Q13113 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1IP1Q13113 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1IP1Q13113 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms