Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECH1Q13011 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECH1Q13011 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECH1Q13011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECH1Q13011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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