Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF2Q12933 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAF2Q12933 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF2Q12933 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF2Q12933 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TRAF2Q12933 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms