Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRJQ12913 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRJQ12913 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRJQ12913 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRJQ12913 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRJQ12913 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRJQ12913 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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