Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFSWAPQ12872 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFSWAPQ12872 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFSWAPQ12872 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFSWAPQ12872 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SFSWAPQ12872 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms