Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMOD3Q0VAK6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
LMOD3Q0VAK6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMOD3Q0VAK6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMOD3Q0VAK6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMOD3Q0VAK6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMOD3Q0VAK6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMOD3Q0VAK6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMOD3Q0VAK6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD3Q0VAK6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD3Q0VAK6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.82■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD3Q0VAK6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms