Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SPS100YHR139C 981 nt7.59□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 GPM1YKL152C 744 nt7.59□□□□□ -1.19
SSK1Q07084 AAT1YKL106W 1356 nt7.59□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 UFD1YGR048W 1086 nt7.58□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 YMC2YBR104W 990 nt7.58□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 snR31snR31 225 nt7.58□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 Q0010Q0010 387 nt7.58□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 ALR1YOL130W 2580 nt7.58□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 EMC3YKL207W 762 nt7.57□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 ORT1YOR130C 879 nt7.57□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 TPN1YGL186C 1740 nt7.57□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 LPD1YFL018C 1500 nt7.57□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 ESS1YJR017C 513 nt7.56□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 THI3YDL080C 1830 nt7.56□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 KGD2YDR148C 1392 nt7.56□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 HXT11YOL156W 1704 nt7.55□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 TOM71YHR117W 1920 nt7.55□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.55□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 snR4snR4 186 nt7.55□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 YLR072WYLR072W 2082 nt7.55□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 FIT1YDR534C 1587 nt7.54□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 CTI6YPL181W 1521 nt7.54□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 IML3YBR107C 738 nt7.54□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 YKL053WYKL053W 375 nt7.53□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 DUR3YHL016C 2208 nt7.53□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 SAN1YDR143C 1833 nt7.52□□□□□ -1.2
SSK1Q07084 PGC1YPL206C 966 nt7.52□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 YLR173WYLR173W 1827 nt7.52□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.51□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.51□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.51□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 SRM1YGL097W 1449 nt7.51□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 MAS1YLR163C 1389 nt7.5□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 ABZ2YMR289W 1125 nt7.5□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 NSG2YNL156C 900 nt7.5□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 AMF1YOR378W 1548 nt7.49□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.48□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 MHF1YOL086W-A 273 nt7.48□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 GGA2YHR108W 1758 nt7.48□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 DUS3YLR401C 2007 nt7.47□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 YBR232CYBR232C 360 nt7.47□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 ENO2YHR174W 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
SSK1Q07084 PAU5YFL020C 369 nt7.46□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 MRS4YKR052C 915 nt7.46□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 FTH1YBR207W 1398 nt7.46□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 YMR210WYMR210W 1350 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 ADE16YLR028C 1776 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 SBP1YHL034C 885 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 TAF13YML098W 504 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 POP2YNR052C 1302 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 AAC3YBR085W 924 nt7.43□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 STP3YLR375W 1032 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 YIL177CYIL177C 5277 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 APS2YJR058C 444 nt7.41□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 NIF3YGL221C 867 nt7.4□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 POT1YIL160C 1254 nt7.4□□□□□ -1.22
SSK1Q07084 RTG2YGL252C 1767 nt7.39□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 snR86snR86 1004 nt7.39□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 TPC1YGR096W 945 nt7.39□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 SRP54YPR088C 1626 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 TUB4YLR212C 1422 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 SEN2YLR105C 1134 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 LEU2YCL018W 1095 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 NAM8YHR086W 1572 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 DIA4YHR011W 1341 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 GSF2YML048W 1212 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 LEA1YPL213W 717 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 MET30YIL046W 1923 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 ABP1YCR088W 1779 nt7.36□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 CDD1YLR245C 429 nt7.36□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 YNL190WYNL190W 615 nt7.36□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 GAS1YMR307W 1680 nt7.35□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 HSV2YGR223C 1347 nt7.35□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 YJL009WYJL009W 327 nt7.35□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 TMS1YDR105C 1422 nt7.35□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 PFS2YNL317W 1398 nt7.34□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 PUP1YOR157C 786 nt7.34□□□□□ -1.23
SSK1Q07084 GCD11YER025W 1584 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 YJL064WYJL064W 396 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 REX2YLR059C 810 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 PTC6YCR079W 1329 nt7.32□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 NAS2YIL007C 663 nt7.32□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.32□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 GNP1YDR508C 1992 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 LAS17YOR181W 1902 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 NAP1YKR048C 1254 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 PAR32YDL173W 888 nt7.3□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 PAU19YMR325W 375 nt7.3□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 MDH2YOL126C 1134 nt7.3□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 HIS3YOR202W 663 nt7.3□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 YBR056WYBR056W 1506 nt7.29□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 THP3YPR045C 1413 nt7.28□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 YPT11YNL304W 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
SSK1Q07084 FSH2YMR222C 672 nt7.27□□□□□ -1.25
SSK1Q07084 LYS20YDL182W 1287 nt7.26□□□□□ -1.25
SSK1Q07084 PAB1YER165W 1734 nt7.24□□□□□ -1.25
SSK1Q07084 VBA3YCL069W 1377 nt7.24□□□□□ -1.25
SSK1Q07084 NDE2YDL085W 1638 nt7.24□□□□□ -1.25
SSK1Q07084 SLM3YDL033C 1254 nt7.24□□□□□ -1.25
SSK1Q07084 MEP1YGR121C 1479 nt7.24□□□□□ -1.25
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