Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RING1Q06587 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RING1Q06587 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RING1Q06587 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RING1Q06587 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RING1Q06587 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RING1Q06587 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RING1Q06587 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RING1Q06587 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RING1Q06587 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RING1Q06587 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RING1Q06587 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RING1Q06587 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RING1Q06587 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RING1Q06587 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RING1Q06587 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RING1Q06587 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RING1Q06587 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RING1Q06587 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RING1Q06587 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RING1Q06587 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RING1Q06587 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RING1Q06587 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RING1Q06587 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RING1Q06587 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RING1Q06587 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RING1Q06587 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RING1Q06587 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RING1Q06587 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RING1Q06587 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RING1Q06587 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RING1Q06587 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RING1Q06587 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RING1Q06587 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RING1Q06587 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RING1Q06587 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RING1Q06587 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RING1Q06587 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RING1Q06587 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RING1Q06587 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RING1Q06587 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RING1Q06587 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RING1Q06587 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RING1Q06587 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RING1Q06587 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RING1Q06587 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RING1Q06587 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RING1Q06587 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RING1Q06587 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RING1Q06587 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RING1Q06587 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RING1Q06587 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RING1Q06587 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RING1Q06587 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RING1Q06587 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RING1Q06587 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RING1Q06587 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RING1Q06587 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RING1Q06587 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RING1Q06587 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RING1Q06587 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RING1Q06587 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RING1Q06587 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RING1Q06587 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RING1Q06587 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RING1Q06587 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RING1Q06587 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RING1Q06587 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RING1Q06587 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RING1Q06587 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RING1Q06587 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RING1Q06587 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RING1Q06587 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RING1Q06587 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RING1Q06587 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RING1Q06587 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms