Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDSRQ06136 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDSRQ06136 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDSRQ06136 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDSRQ06136 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDSRQ06136 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms