Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CTDSPL2Q05D32 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CTDSPL2Q05D32 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CTDSPL2Q05D32 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CTDSPL2Q05D32 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CTDSPL2Q05D32 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CTDSPL2Q05D32 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CTDSPL2Q05D32 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CTDSPL2Q05D32 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CTDSPL2Q05D32 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTDSPL2Q05D32 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTDSPL2Q05D32 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CTDSPL2Q05D32 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTDSPL2Q05D32 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTDSPL2Q05D32 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CTDSPL2Q05D32 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms