Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNASELQ05823 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNASELQ05823 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RNASELQ05823 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNASELQ05823 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASELQ05823 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNASELQ05823 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms