Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROM1Q03395 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROM1Q03395 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROM1Q03395 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms