Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFAIP2Q03169 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFAIP2Q03169 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP2Q03169 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP2Q03169 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFAIP2Q03169 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFAIP2Q03169 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms